Kindaichi Kosuke vs. Akechi Kogoro, 金田一耕助VS明智小五郎

Kindaichi Kosuke vs. Akechi Kogoro xoay quanh một câu chuyện dài về ân oán giữa hai hãng buôn dược phẩm Ganso và Honke, bắt nguồn từ một công ty kinh doanh dược phẩm của Tokiya Manemon. Sau khi truyền lại công thức cho hai người học trò cưng, sự bất hòa và ác cảm giữa họ đã dẫn đến sự chia rẽ thành hai phe. Biến cố xảy ra khi con cả nhà Honke đầu độc thiếu chủ nhà Ganso và sau đó mất tích, gây ra nhiều bi kịch và bí ẩn trong cốt truyện.